我正在将模型的 R 和 SAS 的 GLM 输出与 Gamma 分布进行比较。点估计是相同的,但它们对标准误差的估计不同,因此 p 值也不同。
有谁知道为什么?我想知道 R 和 SAS 是否使用不同的方法来估计标准误差?也许 MLE 与时刻方法?
R 示例代码
set.seed(2)
test = data.table(y = rnorm(100, 1000, 100), x1 = rnorm(100, 50, 20), x2 = rgamma(100, 0.01))
model = summary(glm(formula = y ~ x1+x2 , family = Gamma(link = "log"), data = test))
使用此处生成的相同数据,我使用以下代码在 SAS 中运行模型:
proc genmod data= test_data;
model y = x1 x2 /link= log dist= gamma;
run;
R 的输出如下:
Call:
glm(formula = y ~ x1 + x2, family = Gamma(link = "log"), data = test)
Deviance Residuals:
Min 1Q Median 3Q Max
-0.26213 -0.08456 -0.01033 0.08364 0.20878
Coefficients:
Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
(Intercept) 6.9210757 0.0324674 213.170 <2e-16 ***
x1 -0.0003371 0.0005985 -0.563 0.575
x2 0.0234097 0.0627251 0.373 0.710
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
(Dispersion parameter for Gamma family taken to be 0.01376099)
Null deviance: 1.3498 on 99 degrees of freedom
Residual deviance: 1.3436 on 97 degrees of freedom
AIC: 1240.6
Number of Fisher Scoring iterations: 4
SAS 的输出:
请您参考如下方法:
默认情况下,R 以与 sas/genmod/model 选项 scale=pearson 相同的方式计算 scale=1/dispersion 参数。尺度参数的选择会影响 SE。请参阅此处的文档:
https://support.sas.com/documentation/cdl/en/statug/63033/HTML/default/viewer.htm#statug_genmod_sect022.htm
默认情况下,SAS/genmod 提供形状参数的 MLE。假设拟合的 gamma 模型存储在列表“fit”中。要在 R 中加载 MASS 库,然后键入
gamma.shape(fit)
这给出了形状参数 alpha 的 MLE。
如果你输入
summary(fit, dispersion=1/gamma.shape(fit)$alpha))
汇总函数在计算 SE 时将使用 alpha 的 MLE,并且它们将完全匹配 SAS/genmod。
我将就此单独发表一篇文章。虽然summary.glm 给出了正确的SE(使用指定的离散值),但它没有打印正确的AIC 值(它不使用指定的离散,而是使用用Pearson 残差计算的值)。差异很小,但我称之为错误。




